MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter hepaticus ATCC 51449 chromosome

Total Repeats: 2779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004917	TTTA	2	8	33	40	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004917	ACATA	2	10	44	53	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_004917	A	6	6	57	62	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004917	TAAATA	2	12	111	122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004917	CTT	2	6	2451	2456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004917	ATA	3	9	2474	2482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004917	C	6	6	5612	5617	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_004917	CTA	2	6	6205	6210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004917	ATT	2	6	6215	6220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004917	TAAT	2	8	6258	6265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004917	ATTTT	2	10	6917	6926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004917	T	6	6	6923	6928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004917	ATGAG	2	10	7001	7010	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004917	TTTA	2	8	7061	7068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004917	ACC	2	6	7687	7692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_004917	C	10	10	7738	7747	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_004917	AAAAT	2	10	7777	7786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004917	AAT	2	6	7799	7804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004917	TAC	2	6	8930	8935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004917	ATT	2	6	8942	8947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004917	CAAA	2	8	9642	9649	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_004917	A	6	6	11266	11271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004917	TAT	2	6	11272	11277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004917	TTA	2	6	11285	11290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004917	TA	3	6	11308	11313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004917	AAT	2	6	11331	11336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004917	CCT	2	6	16679	16684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_004917	TTC	2	6	18146	18151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004917	A	6	6	18181	18186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004917	T	6	6	18191	18196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004917	CTT	2	6	18226	18231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_004917	TTG	2	6	18235	18240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004917	A	8	8	18281	18288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004917	ATC	2	6	18309	18314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_004917	ATA	2	6	18330	18335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004917	AG	3	6	20667	20672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004917	AAT	2	6	20682	20687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004917	ATG	2	6	20710	20715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004917	CT	3	6	20719	20724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_004917	AG	3	6	20735	20740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004917	ATAC	2	8	24289	24296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_004917	CTT	2	6	24407	24412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_004917	CTT	2	6	24416	24421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_004917	TCT	2	6	24426	24431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_004917	T	6	6	26495	26500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004917	TA	3	6	28756	28761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004917	TGT	2	6	30778	30783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004917	ATA	2	6	30792	30797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004917	TCCT	2	8	34214	34221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_004917	AT	3	6	34235	34240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004917	T	6	6	34306	34311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004917	ATT	2	6	34695	34700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004917	AAG	2	6	34718	34723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004917	TTGCC	2	10	35389	35398	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_004917	GGA	2	6	35403	35408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004917	ATT	2	6	36708	36713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004917	ATAC	2	8	36726	36733	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_004917	ATTC	2	8	36793	36800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_004917	TGT	2	6	36816	36821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004917	TTTG	2	8	36837	36844	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004917	TTCTTT	2	12	36926	36937	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_004917	TGG	2	6	36943	36948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004917	AAAT	2	8	37149	37156	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004917	TA	3	6	39802	39807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004917	CAT	2	6	39825	39830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_004917	ATT	2	6	41983	41988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004917	T	6	6	41987	41992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004917	CTC	2	6	43669	43674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_004917	TC	3	6	44507	44512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_004917	ATTA	2	8	45222	45229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004917	A	6	6	45229	45234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004917	AAT	2	6	45257	45262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004917	AAAT	2	8	45278	45285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004917	AG	3	6	45994	45999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004917	TA	4	8	47945	47952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004917	TAAT	2	8	47986	47993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004917	ATA	2	6	47996	48001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004917	ATT	2	6	48002	48007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004917	TAA	2	6	48011	48016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004917	TAA	2	6	48021	48026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004917	ATT	2	6	48047	48052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004917	CT	3	6	48074	48079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_004917	TAT	2	6	48084	48089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004917	A	6	6	50005	50010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004917	ATT	2	6	51793	51798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004917	A	6	6	51823	51828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004917	A	7	7	51848	51854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004917	T	14	14	51877	51890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004917	CTT	2	6	55259	55264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_004917	GAAG	2	8	55296	55303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004917	AATAC	2	10	56302	56311	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_004917	T	14	14	56319	56332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004917	ATACT	2	10	56336	56345	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_004917	AT	3	6	56380	56385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004917	TGT	2	6	60300	60305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004917	AT	3	6	60315	60320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004917	TAG	2	6	60377	60382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004917	A	6	6	60422	60427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004917	T	6	6	60462	60467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004917	AAC	2	6	60613	60618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_004917	AGG	2	6	63545	63550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004917	CCAA	2	8	70517	70524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_004917	CCTTG	2	10	71136	71145	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_004917	AT	3	6	71857	71862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004917	TAAA	2	8	76878	76885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004917	GGA	2	6	76886	76891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004917	TGA	2	6	76906	76911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004917	TGA	2	6	78326	78331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004917	TGGG	2	8	78345	78352	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004917	C	8	8	81890	81897	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_004917	A	6	6	81935	81940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004917	AATA	2	8	84881	84888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004917	ATG	2	6	84949	84954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004917	A	7	7	85007	85013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004917	TGA	2	6	85023	85028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004917	TGT	2	6	85041	85046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004917	T	6	6	85085	85090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004917	ATAA	2	8	85143	85150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004917	TTCT	2	8	85162	85169	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_004917	GTT	2	6	85243	85248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004917	AAT	2	6	85254	85259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004917	TCC	2	6	87666	87671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_004917	GAT	2	6	89882	89887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004917	ATT	2	6	89892	89897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004917	AG	3	6	89952	89957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004917	AAT	2	6	95068	95073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004917	TAA	2	6	95151	95156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004917	T	6	6	96132	96137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004917	TAA	2	6	96208	96213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004917	CTC	2	6	96240	96245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_004917	TAG	2	6	96255	96260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004917	T	6	6	96292	96297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004917	T	6	6	96333	96338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004917	A	6	6	97563	97568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004917	CCT	2	6	101454	101459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_004917	TACA	2	8	101467	101474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_004917	ATTTT	2	10	101530	101539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004917	GCTTA	2	10	104007	104016	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_004917	AT	3	6	104019	104024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004917	AGG	2	6	104922	104927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004917	AGG	2	6	105867	105872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004917	A	7	7	105927	105933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004917	AT	3	6	105935	105940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004917	AGGG	2	8	105941	105948	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004917	ATA	2	6	106156	106161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004917	TAT	2	6	106180	106185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004917	TA	3	6	109433	109438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004917	TTTA	2	8	109461	109468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004917	A	6	6	109510	109515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004917	AT	3	6	114327	114332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_004917	TAT	2	6	202417	202422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_004917	TTC	2	6	202499	202504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_004917	ATG	2	6	202542	202547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_004917	ACC	2	6	202823	202828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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301	NC_004917	A	6	6	203569	203574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_004917	TAT	2	6	274108	274113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_004917	AT	3	6	274112	274117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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